$(1)$ 证明 $OD\perp DE$
解(证明):
连接 $BD$,
因为 $AB$ 是$\odot O$的直径,所以$\angle ADB = \angle BDC=90^{\circ}$。
在$Rt\triangle BDC$中,$E$为$BC$的中点,根据直角三角形斜边中线定理:
直角三角形斜边的中线等于斜边的一半,所以$DE = BE = CE$,
则$\angle EDB=\angle EBD$。
又因为$OD = OB$,所以$\angle ODB=\angle OBD$。
那么$\angle ODE=\angle ODB+\angle EDB=\angle OBD+\angle EBD=\angle ABC$。
已知$\angle ABC = 90^{\circ}$,所以$\angle ODE = 90^{\circ}$,即$OD\perp DE$。
$(2)$ 求阴影部分的面积
解:
已知$AB = 12$,则$OA=OD=\frac{1}{2}AB = 6$。
因为$\angle BAC = 30^{\circ}$,$\angle AOD$与$\angle BAC$所对的弧都是$\overset{\frown}{AD}$,根据圆周角定理:
一条弧所对圆周角等于它所对圆心角的一半 ,
所以$\angle AOD = 2\angle BAC=60^{\circ}$。
过点$D$作$DF\perp AB$于点$F$,在$Rt\triangle ODF$中,$\sin\angle AOD=\frac{DF}{OD}$,
则$DF = OD\sin60^{\circ}=6×\frac{\sqrt{3}}{2}=3\sqrt{3}$;$\cos\angle AOD=\frac{OF}{OD}$,
则$OF = OD\cos60^{\circ}=6×\frac{1}{2}=3$。
${S}_{\triangle AOD}=\frac{1}{2}× OA× DF=\frac{1}{2}×6×3\sqrt{3}=9\sqrt{3}$。
扇形$AOD$的面积${S}_{扇形AOD}=\frac{n\pi{r}^{2}}{360}$($n$是圆心角度数,$r$是半径),
这里$n = 60^{\circ}$,$r = 6$,所以${S}_{扇形AOD}=\frac{60\pi×6^{2}}{360}=12\pi$。
阴影部分面积$S = {S}_{扇形AOD}-{S}_{\triangle AOD}=12\pi - 9\sqrt{3}$。
综上,$(1)$ 证明如上;$(2)$ 阴影部分面积为$\boldsymbol{12\pi - 9\sqrt{3}}$。